“在传统的调控基因组学方法中主要需要考虑个体之间的差异,而我们优化之后的深度学习算法允许通过将基因组平铺到以个体特征为中心的序列dna窗口中。”

        “然后利用个体内部的差异,从而从单个样本中产生大量的训练数据集。”

        “这是用于从原始dna序列预测分子特征的一维卷积神经网络。”

        “第一个卷积层的过滤器扫描输入序列中的图案。随后的池化减少了输入维度,并且额外的卷积层可以模拟前一层中dna序列的交互。”

        “再看这里,c图由b图中所示的神经网络预测的野生型和突变序列的响应变量被用作另一个神经网络的输入,该网络预测变体分数并允许区分正常与有害变体。”

        “d再通过对齐最大程度地激活过滤器的基因序列并创建序列基序来可视化卷积过滤器。”

        “这是序列窗口的突变图。行对应于四种可能的碱基对替换,列对应于序列位置。任何序列变化的预测影响都是用颜色编码的。”

        “顶部的字母表示野生型序列,每个核苷酸的高度表示突变的最大影响......”

        结束对狮城研发中心的调研后,李渺渺问道:“你觉得怎么样?”

        “他说的那些,我完全听不懂啥意思。”

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